El Museo cuenta con una importante colección de objetos entre los que se encuentran documentos originales, colección de billetes, colección de filatelia y de armas, restos de piezas jesuíticas, además de una sección dedicada al que fuera dictador y presidente Gral. Alfredo Stroessner. La colección forma un conjunto total de 4.000 piezas, cuyo mantenimiento gestiona la familia Hrisuk.